Мистериозни вируси открити в човешките черва и уста?!
Тези „вироиди“ могат да повлияят на генната активност в човешкия микробиом
Мистериозни вируси открити в човешките черва и уста?!
Учените са открили невиждан досега клас вирусоподобни образувания. Те се крият в човешките черва и уста. Тези „вироиди“ могат да повлияят на генната активност в човешкия микробиом, съобщи Science.
Част от тях са бактерии
Изследователите потвърдиха един гостоприемник за тези вироиди. Това е именно обикновена бактерия, открита в устата, наречена Streptococcus sanguinis. Те все още не са потвърдили допълнителни гостоприемници, но подозират, че поне част от тях са бактерии.
Вироидите са малки бримки от РНК, генетичен братовчед на ДНК. Установено е, че заразяват предимно растения, като например картофи. Вироидите се различават от по-големите вируси, базирани на РНК, по няколко начина. Първо, те са голи, лишени от защитните обвивки, които вирусите използват, за да държат своя генетичен материал. Второ, тяхната РНК не съдържа инструкции за изграждане на протеини. Вирусите носят инструкции за външните си обвивки и за определени ензими, които трябва да репликират. Вироидите кооптират тези ензими от своите гостоприемници.
Могат да заразят допълнителни гостоприемници
Въпреки че някога се смяташе, че вироидите заразяват само растенията, последните проучвания предполагат, че те могат да заразят допълнителни гостоприемници. Такива са животни, гъбички или бактерии. В новото проучване изследователите са търсили възможни вироиди сред гените на микробите, които се намират в човешкото тяло.
Обелиски – новоименуван клас вироиди
В доклад, публикуван на 21 януари в базата данни за предпечат bioRxiv, екипът представи „Обелиски“, новоименуван клас вироиди. Те ги открили в човешките черва и уста. Общо те идентифицирали близо 29 960 примера на вироидите. (Работата все още не е рецензирана или публикувана в научно списание.)
Те ги нарекли обелиски, защото вторичната структура на вироидите – 3D форма, която те приемат, като се сгъват върху себе си – се предвижда да изглежда като тънка пръчка.
Метатранскриптоми
Използвайки по-рано публикувани данни, изследователите анализирали показанията на генната активност в различни микробни общности в тялото. Тези обобщения на генната активност са известни като „метатранскриптоми“.
Учените открили, че обелиските присъстват в приблизително 7% от метатранскриптомите от човешки изпражнения. Тези проби от изпражнения дават моментна снимка на генната активност в микробиома на червата. Екипът също така открил новоименуваните вироиди в 17 от 32, или около 53%, от метатранскриптомите в устата, които те скринирали.
При по-нататъшни анализи екипът успял да съпостави обелиск с неговия домакин S. sanguinis . „Въпреки че не знаем „домакините“ на други обелиски, разумно е да се предположи, че поне малка част може да присъства в бактериите.“, пишат те в препечатката.
Интересното е, че някои от новооткритите обелиски изглежда съдържат инструкции за ензими. Те са необходими за репликация, което ги прави по-сложни от вироидите, които бяха описани по-рано. Като повечето вироиди обаче, те все още нямали инструкции за защитна на външната обвивка.
Все още не е известно как и дали тези вироиди засягат човешкото здраве, въпреки че те могат да оформят човешкия микробиом, тъй като поне някои заразяват бактериите. Освен това продължава дискусия за това дали вирусите са еволюирали от вироиди или вироидите действително са еволюирали от вируси. Това ново откритие може да помогне за подхранването на този дебат.
Прочетете повече в Science.
